品牌

10X Genomics Chromium

型号

V3.1

生产厂商

北京博奥晶典生物技术有限公司

产地信息

北京市北京经济技术开发区科创六街88号院10号楼101室

技术规格及参数

乙方提供的基本数据分析包括：
乙方的全部数据分析包含4部分：乙方在分析完数据分析一里面的分析内容后交付给甲方，甲方在3个工作日内 ，选择一个分群的最终结果，然后乙方继续完成数据分析二里面的分析内容。数据分析内容三和四，确定好分群方式及数据分析方案后，一共分三次来提供。基本分析内容：（分析内容一、二），标准分析内容：（分析内容一、二、三、四）数据分析内容一：单个样品分群分析、差异基因富集分析、GO富集分析、KEGG富集分析、Disease富集分析（仅限于人）、Reactome富集分析、GSEA富集分析、蛋白互作网络 蛋白互作网络、转录因子预测、转录因子预测。
分析内容：Cell Ranger原始数据预处理及统计、原始数据评估、数据校正：cell barcode和UMI进行校正、参考基因组比对、有效细胞数过滤、单细胞基因表达谱、Cell Ranger分群及差异表达分析、细胞群体k-means聚类分析及可视化、细胞群体Graph-based聚类分析及可视化、获取每个亚群差异高表达的基因、每个亚群的Top20基因聚类分析、亚群的Top20基因表达热图、Seurat分群及差异表达分析、细胞群体聚类分析，包含tSNE和UMAP结果，获取每个亚群差异高表达的基因，每个亚群的Top20基因聚类分析，亚群的Top20基因表达热图
、基因注释分析 、GO注释分析、KEGG注释分析、Disease注释分析（仅限于人）。
数据分析内容二：亚群特征基因富集分析
数据分析内容三：样品差异比较分析，分析次数不超过样品数。分析的周期为8个工作日（差异比较次数小于等于3次），每增加一次差异比较，周期增加2个工作日。分析内容：Cell Ranger原始数据预处理、原始数据评估、数据校正：cell barcode和UMI进行校正，有效细胞统计、参考基因组比对、Cell Ranger多样本分群及差异表达分析、细胞群体k-means聚类分析及可视化、细胞群体Graph-based聚类分析及可视化、获取每个亚群差异高表达的基因、每个亚群的Top20基因聚类分析、亚群的Top20基因表达热图、每个样本各亚群可视化结果、统计相同亚群在不同样品中细胞数量、Seurat多样本分群及差异表达分析、细胞群体聚类分析，包含tSNE和UMAP结果、获取每个亚群差异高表达的基因、每个亚群的Top20基因聚类分析、亚群的Top20基因表达热图、每个样品细胞分群图、每个样本各亚群Top20基因、统计相同亚群在不同样品中细胞数、基因注释分析、GO注释分析、KEGG注释分析、Disease注释分析（仅限于人）、差异基因富集分析、GO富集分析、KEGG富集分析、Disease富集分析（仅限于人）
、Reactome富集分析、GSEA富集分析、蛋白互作网络、蛋白互作网络、转录因子预测、转录因子预测
数据分析内容四：拟时间序列分析，分析次数不超过样品数。分析的周期为5个工作日（分析次数小于等于3次），每增加一次分析，周期增加2个工作日。
单细胞轨迹构建 基因选择、轨迹构建、加入时间构建拟时间轨迹、差异表达分析、差异基因在不同表达状态的散点图、差异基因拟时间表达轨迹图、差异基因聚类热图。

售后及质保要求

1.交付期的要求：样品质检合格后【35】工作日内。
2.服务期限：自合同签订之日起一年。服务期满后，采购单位可根据供应商履约情况确定合同期限是否延长，但最长不超过3年
3.售后服务要求：合同签订后供应商至少开展两次技术培训，集中培训工作人员；合同期间供应商提供对接沟通专员及专业咨询服务；未经授权，供应商不得外传、私自使用筛查结果和数据
4.付款方式：合同签订之日起30日内向供应商支付合同总金额的75％，供应商提供分析结果后，再支付尾款总金额的25%。